داستان بازی در ادامه ی دو نسخه ی قبل روایت می شود و شما همچنان کنترل شخصیت پرافیت را برعهده دارید، پس از مبارزه با نیروهای بیگانه و شکست دادن آن ها، پرافیت به خانه ی خود در نیویورک باز می گردد اما نیویورک توسط بیگانگان به تسخیر درآمده و با یک خرابه تفاوت چندانی ندارد. حال شما باید برای آزادی سازی شه...